舟山市内有两个主要码头，“沈家门客运站码头”和“朱家尖蜈蚣峙码头”，下面将分别介绍两个码头的航线，船次和发船时间以2023年2月为标准，船次根据游淡旺季会有增减，目前是旅游淡季，船次比较少，相信到了旅游旺季时船次会有增加。
浙江省舟山群岛
朱家尖蜈蚣峙码头
地址：舟山市朱家尖镇普度路4号
朱家尖码头离市区8-9公里，有多趟公交车可以到达，舟山所辖比较知名的一些旅游性海岛基本都是从这个码头坐船去。，另外这个码头外观很漂亮，有点布达拉宫的感觉。
朱家尖蜈蚣峙码头
朱家尖-普陀山（往返线路）
普陀山是中国四大佛教名山之一，也是舟山最有名的海岛，每天6:20-21:50间有多趟从朱家尖到普陀山的船，根据船型和舱位的差异，价格从30-108不等。
朱家尖-嵊山岛/枸杞岛（嵊泗列岛）（往返线路）
嵊泗列岛是舟山群岛中离舟山市最远的一个岛屿群，嵊泗旅游资源开发的很好，游客常去的有四个岛，泗礁岛、枸杞岛、嵊山岛、花鸟岛。其中枸杞岛和嵊山岛有大桥相连，所以可以一起玩，像后头湾的无人村、东涯绝壁都在嵊山岛上，大王沙滩、山海奇观都在枸杞岛上。朱家尖每天早上7：45有一班船发往枸杞岛/嵊山岛码头，船程3.5小时左右，先停枸杞岛码头，再停嵊山岛码头，如果天气不好可能只停这两个码头中的一个（可以下船后做公交车去另一个岛）。票价中舱165、卧铺200、上舱235。
嵊山岛后头湾无人村
嵊山岛东崖绝壁
枸杞岛大王沙滩
枸杞岛山海奇观
这里顺便说一下，假如你玩了枸杞/嵊山岛后，可以从这里再乘船去花鸟岛、泗礁岛等其它嵊泗列岛的岛屿，也可以从这里坐船到洋山沈家湾码头，沈家湾码头有大巴去上海南浦客运站，所以可以把旅行规划成“舟山-枸杞/嵊山-嵊泗其它岛屿-上海”这种不走回头路的行程。
朱家尖-东极庙子湖岛-东极青浜岛-东极东福山岛（往返线路）
这几个岛屿就是所谓的“东极岛”，其实东极岛不是一个正式的地理名称，它指舟山市东极镇下属所有列岛的总称，游客常去的东极所辖岛屿大体就是上面三个。其中庙子湖岛是东极镇镇政府所在岛屿，所以可以看做是主岛，韩寒的《后会无期》就是在庙子湖岛取景。青浜岛和东福山岛离庙子湖很近，前一阵有个“海誓山盟”石头碎了，那个石头就在青浜岛上。
每天早上8:10朱家尖有一班船发出前往东极，先到庙子湖、再到青浜、最后到东福山，返程刚好反过来，最后还是回到朱家尖。所以想三个岛都玩的朋友可以朱家尖-庙子湖-青浜-东福山-朱家尖的顺序，也可以朱家尖-东福山-青浜-庙子湖-朱家尖的顺序。
朱家尖-白沙岛（往返线路）
白沙岛离朱家尖只有20分钟船程，岛上可以钓鱼，还有个后沙头沙滩。每天朱家尖至少有两班船到白沙岛，票价20元起。
沈家门客运站码头
地址：舟山市普陀区兴建路891号
沈家门码头就在舟山的沈家门商圈，离国际水产市场、滨港路都很近。
沈家门-桃花岛（往返线路）
据说这里就是金庸笔下黄药师居住的桃花岛，目前也是舟山比较热门的旅游小岛。沈家门每天有超过6班船发往桃花岛，票价15-27元间，比较有趣的是发往桃花岛的船都是类似“金庸号”“侠侣号”这种名字。
沈家门-六横岛（往返线路）
每天有超过10班船发往六横岛，有的停靠六横大岙码头，有的停靠六横台门码头，所以去这个岛的朋友请研究一下哪个码头更方便，普通船型18-25元，快艇40-50元。
沈家门-虾峙岛（往返线路）
岛的名字很有趣，因其形状如虾浮游于海上，加上岙门众多，成犄角对峙之势，故得名虾峙岛。岛上有奇峰、异石、渔港、碧海等自然景观，还有近200年历史的清凉庵，也是舟山周边不错的旅游小岛。每天有至少5班船前往虾峙岛，票价18-32元。
沈家门-蚂蚁岛（往返线路）
蚂蚁岛是个旅游生态岛，岛上森林覆盖率很高。每天4班船，票价13-15元。
沈家门-登步岛（往返线路）
登步岛是著名的登步岛血战发生地。1949年为解放登步岛，中国人民解放军以4个营兵力与国民党有海、空军掩护的16个营兵力激战两昼夜，目前岛上有登步战斗革命烈士纪念碑。每天4班船到登步岛，票价12元。
沈家门-葫芦岛（往返线路）
每天两班船到葫芦岛，票价17元。
